原文链接：
故事一开始，暗影界的仲裁者辞去仲裁者之位，成为一名格里恩人。暗影界一片混乱，但典狱长力挽狂澜，带领灵魂前往噬渊。随后四大盟约之主联手解除了典狱长身上的封印，让典狱长成为新任仲裁者。暗影界开始涌动心灵能量，暗影界中秩序井然。与此同时，典狱长将灵魂残缺混乱的希尔瓦娜斯的灵魂归还原位，却不小心让希尔瓦娜斯邪恶的性格占了上风，于是希尔瓦娜斯将这位高贵的联盟之王、部落的缔造者、牛头人酋长、达拉然的大法师派往了艾泽拉斯。
艾泽拉斯的所有人都还没搞清楚发生了什么，就被恩佐斯入侵了。为了对抗上古之神，联盟和部落立刻联手，通过黑龙鳞片制成的斗篷，随处可见的艾泽里特，以及心之秘室的力量，将恩佐斯封印了起来。在艾萨拉女王的永恒王宫中，所有人都亲眼目睹了艾萨拉女王封印恩佐斯的情景。随后艾萨拉女王将纳沙塔尔沉入海底，决定将恩佐斯永远封印起来。
此时，希尔瓦娜斯借助暗影之力复活了大英雄萨鲁法尔，萨鲁法尔将萨尔送往外域隐居，并复活了希尔瓦娜斯派来护送他的两名亡灵盗贼，一路来到暴风城，萨鲁法尔受到了联盟之王的亲自迎接。
萨鲁法尔与联盟之王沟通后，联盟之王意识到部落是一个重大威胁，希尔瓦娜斯的灵魂并不善良。库尔提拉斯舰队集结，由吉安娜率领，进攻部落的盟友赞达拉，部落援军赶来救援。联盟突击部队进入达萨罗，却发现拉斯塔哈大王已被净化的先知祖尔复活。溃败的联盟突击部队在无尽之海上被黄金舰队击溃，撤退至库尔提拉斯。库尔提拉斯舰队损失惨重，不得不撤出联盟。吉安娜也被库尔提拉斯流放。
联盟不能再这样下去了，于是便派出军队进攻洛丹伦。然而吉安娜的冰霜魔法却被洛丹伦的魔药击败。萨鲁法尔此时才恍然大悟，回到了酋长身边。然而那瓶不分敌友的魔药不仅清除了冰霜复活了部落士兵，还复活了联盟士兵。联盟和部落完全势均力敌。为了帮助部落取得胜利，希尔瓦娜斯派出军队进攻黑海岸，但投石机被泰达希尔的暗夜精灵摧毁，一路撤退到了灰谷南部，奥格瑞玛危在旦夕。
就在部落首领们不知所措的时候，原本插在希利苏斯的陨落泰坦之剑突然腾空而起，艾泽里特重回艾泽拉斯，原来是燃烧军团入侵了！崛起的燃烧军团势不可挡，先是在阿古斯击溃了圣光军团，复活了灭世者阿古斯，并封印了所有泰坦万神殿的灵魂。萨格拉斯的狱卒伊利丹赶紧来帮助大家，用眼光束复活了圣光之母泽拉，但依然没用。圣光军团见大势已去，决定继续在阿古斯与燃烧军团作战，以便伊利丹和艾泽拉斯的人民能够回到艾泽拉斯抵抗燃烧军团。伊利丹、卡德加等人前往暗夜要塞，发现古尔丹已经复活。 古尔丹夺取了伊利丹的肉体，并将伊利丹的灵魂放逐到虚空，但古尔丹未能打开传送门。艾利桑德违背了与燃烧军团的盟约，古尔丹不得不进攻守望者地窟，但最终被科达娜·邪歌背叛。在一群恶魔猎手的拼命帮助下，古尔丹失去了伊利丹的肉体，守望者地窟的大门彻底关闭。部落与联盟联军在破碎海滩与注定要失败的燃烧军团展开了激烈的战斗，英雄们鼓舞了联盟与部落的两位领袖，重伤奄奄一息的沃金和前国王瓦里安复活，最终击败了燃烧军团。因为这次失败，古尔丹被污染者阿克蒙德传送回平行时空的德拉诺。
被送回平行世界德拉诺的古尔丹发现燃烧军团在德拉诺被联盟和部落击败，急忙赶来主持大局。他先是复活了奄奄一息的阿克蒙德，然后协助阿克蒙德召唤燃烧军团占领地狱火堡垒。萨尔看到这一幕，觉得纳格兰复活了加尔鲁什·地狱咆哮。加尔鲁什囚禁了古尔丹和他的暗影议会，用术士的暗影力量建造了黑暗之门，打开黑暗之门将联盟和部落送回艾泽拉斯。但他也受到青铜龙神器力量的影响，被送往锦绣谷。在联盟、部落和四大天神的庆典上，加尔鲁什开心地成为了一名大英雄，就连沃金和萨尔都认为他应该领导部落。这让他嚣张跋扈。
萨尔将加尔鲁什派往奥格瑞玛地下要塞，却被要塞中放置的恐怖亚煞极之心所影响。加尔鲁什不顾萨尔的劝阻，执意要将亚煞极之心送回潘达利亚，最后被亚煞极之心感染。萨尔拼死奋战，却被打昏。加尔鲁什剥离了亚煞极之心的影响，将亚煞极之心送回锦绣谷，途中通过了诺鲁什的考验，封印了傲之煞。最终，亚煞极之心被封印，被污染的锦绣谷也恢复了原貌。与此同时，先知祖尔率领的赞达拉舰队放弃了与魔古的联盟，在联军的攻击下，雷神被封印。
亚煞极之心被封印，但煞魔也开始在潘达利亚肆虐。联盟和部落赶赴调查，但螳螂妖开始对蟠龙脊发动大规模攻击。击败螳螂妖后，他们发现是恐惧之煞在作祟。
为了封印恶灵，众人前往咏春台，打败了盘踞在那里的恐惧恶灵。
在昆莱山脚下，野牛人与联盟部族击败了盘踞在那里的怒煞。随后他们前往影盘寺，封印了叛逆的狂煞，救出了受到影响的影盘首领朱塔兰，击败了憎恨之煞，随后在青龙寺击败了疑惑之煞。
最终，联盟与部落在潘达利亚停止了战斗，并封印了所有邪恶之灵，潘达利亚恢复了和平，从此隐藏在迷雾之中。
潘达利亚突然被迷雾笼罩，黑龙王子拉希奥最先发现这是死亡之翼的影响。果然，死亡之翼在漩涡中复活了！复活的死亡之翼立刻利用龙魂之力连接自己的源甲，飞上天空，准备毁灭艾泽拉斯。
巨龙守护者们齐聚龙眠神殿，准备一举击败死亡之翼。他们先从萨尔手中夺回了巨龙之魂，然后夺回了龙眠神殿顶端巨龙守护者的力量。泰坦赐予的力量回归到了巨龙守护者身上。随后萨尔将巨龙之魂送回了过去的艾泽拉斯，净化了堕落的大主教本尼迪塔斯。
重回艾泽拉斯的萨尔因为元素之力过于强大，不得不返回德拉诺释放元素之力。大地之环开始寻找击败死亡之翼的方法。看到巨龙之魂的力量已经回归守护巨龙，死亡之翼选择将守护巨龙逐一击溃。为了抵抗死亡之翼，托维尔人释放了风元素领主奥拉基尔，范达尔·鹿盔释放了火元素领主拉格纳罗斯。最终在众人的努力下，混乱的元素和大地得到了修复，艾泽拉斯破碎的土地恢复了原貌。死亡之翼只好蛰伏，希望找到毁灭世界的机会。
大地安静了下来。诺森德的巫妖王伯瓦尔摘下统御王冠戴在了阿尔萨斯的头上，在提里奥·弗丁的帮助下复活了洛丹伦的王子阿尔萨斯，让阿尔萨斯成为了新的巫妖王。成为巫妖王的阿尔萨斯立刻在诺森德召集天灾军团，让苏醒的辛达苟萨沉睡在诺森德，同时让希尔瓦娜斯从冰冠堡垒的底部飞到冰封王座，让善良的灵魂回归希尔瓦娜斯。黑锋骑士团和白银十字军的骑士们开始在冰冠冰川举行训练场竞赛，阿尔萨斯也派出黑骑士协助训练部落和联盟的战士，脱颖而出的战士前往奥杜尔，要求观察者阿尔加隆放弃格式化艾泽拉斯。 并阻止了尤格萨隆对泰坦守护者的腐化，同时净化了已经被腐化的泰坦守护者，尤格萨隆被彻底封印。
重获守护巨龙力量的阿莱克丝塔萨前往魔枢，复活了前任蓝龙王玛里苟斯。痛苦中的玛里苟斯意识到凡人应该掌控魔法。他撤回了入侵紫罗兰监狱的蓝龙大军，开始休养生息。
黑锋要塞的死亡骑士遭到了圣光之愿礼拜堂的幽灵袭击，巫妖王现身与弗丁战斗，将灰烬使者变成了堕落的灰烬使者。战败的弗丁将灰烬使者还给了达里安·莫格莱尼。重新拥有父亲遗物的莫格莱尼率领黑锋骑士团向阿尔萨斯宣誓效忠，与弗丁决裂。弗丁宣布白银十字军将分为白银黎明和白银之手骑士团。与此同时，弗丁收到了部落和联盟领袖的来信，部落和联盟同时驱逐了死亡骑士，走投无路的死亡骑士们又回到了巫妖王的麾下。
战败之后，阿尔萨斯决定将纳克萨玛斯空运到东瘟疫之地的斯坦索姆，与银色黎明/白银之手骑士团和血色十字军争夺东瘟疫之地的控制权，与此同时，深知自身不足的阿尔萨斯开始在冰封王座上沉睡。
此时的东部王国，军团手下的凯尔萨斯在复活之后突然背叛了军团。他先是将太阳之井改造成名为安薇娜的人类少女以阻止基尔加丹进入艾泽拉斯，随后又立刻净化了已经化为熵魔的穆鲁，并将他送往银月城。穆鲁将自己的力量分享给血骑士，使得他们放弃了对圣光的信仰。于是血骑士宣布撤出破碎太阳，而对穆鲁行为不理解的德莱尼人则向凯尔萨斯宣战。
凯尔萨斯随后被血精灵加冕为国王，但为了纪念他的父亲，他只允许人们称呼他为王子。
伊利丹在黑暗神殿被玛维复活，但玛维随即被阿卡玛抓获并囚禁。复活后的伊利丹将凯尔萨斯和瓦丝琪召唤回自己的身边，无人看管的盘牙水库开始将外域珍贵的水资源注入赞加沼泽。由于凯尔萨斯及其手下的离开，风暴要塞重新回到了德莱尼人的控制之下。德莱尼人将埃索达赶回了风暴要塞，并打算离开艾泽拉斯和德拉诺。
眼看着破碎的外域即将恢复原状，燃烧军团不得不关闭黑暗之门。
为了维护艾泽拉斯的和平，联盟与部落结成联盟，深入阿奇拉神殿，在神殿深处复活克苏恩，并让克苏恩夺走上古之神的大部分力量。随后范达尔·鹿盔将破碎的流沙权杖重新拼凑起来，重新封闭了阿奇拉废墟，让上古之神沉睡。
瓦里安国王从奥妮克希亚的巢穴中救出了黑龙化身的普瑞斯托女伯爵。为了感谢瓦里安国王，普瑞斯托女伯爵用魔法将瓦里安分裂成两个灵魂，一个温柔随和，一个果断勇敢。果断勇敢的瓦里安成为了一名角斗士，而温柔随和的瓦里安则回到了暴风城当上了国王。
